ماجرای رمان «دفتر حضور و غیاب» درباره اتفاقات زندگی پزشکی به نام دکتر ایو ژئوفروا است و داستان با ورود دختری ۱۸ ساله به مطب او آغاز می شود. دختر، فروشنده کتاب فروشی گاشه است و آلین برتیه نام دارد که دختری زیبا و خوش قلب بوده و سرگذشت پر رنج و دردش از او، زنی کامل و صبور ساخته است. حکایت دکتر ژئوفروا با یک معما شروع می شود که می تواند باعث رسوایی اش شود. این حکایت با عشق و دلبستگی ادامه پیدا می کند اما قدم به قدم به سمت فاجعه ای غم انگیز حرکت می کند...